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由於芝山岩鄰近陽明山，並擁有豐富多樣的植物相，是都市中重要的生態跳島，因此也蘊含了豐富的生物資源。
尤其在鳥類資源部份，自2007年8月至2012年9月，據園區駐站及「芝山鳥類調查小組」之調查結果，共登錄141筆資料，總鳥種數為30科70種，佔全國總鳥種數比率，科為34.9%，種為11.6%，種類相當豐富。
保育等級分類包括有遊隼等一級保育類；臺灣八哥、紫綬帶、紅隼、大冠鷲、東方蜂鷹、鳳頭蒼鷹等二級保育類；及臺灣藍鵲、紅尾伯勞等三級保育類鳥類。
（以上資料摘錄自冠羽vol.223 陳永炅、蔣功國）
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